Francoforte è tra i primi aeroporti al mondo ad impiegare regolarmente scanner "walk-through" per i controlli di sicurezza dei passeggeri. Dopo una fase di test durata circa un anno presso il Concourse A del Terminal 1, la polizia federale tedesca ha autorizzato l'uso su vasta scala del sistema di sicurezza per i viaggi aerei Rohde & Schwarz QPS Walk2000. Quest'ultimo offre un comfort ed una praticità notevolmente maggiori ai controlli di sicurezza: invece di doversi bloccare in una posizione scomoda per la scansione, i passeggeri possono semplicemente passare attraverso lo scanner ad una velocità normale.

Circa 18.000 passeggeri in partenza passano ogni giorno da questo checkpoint: in futuro la prospettiva è di estendere l'uso di questa tecnologia ad altre corsie di controllo di sicurezza nel T1 e di implementarla anche nel nuovo Terminal 3.

La tecnologia ad onde millimetriche utilizzata negli scanner penetra anche gli abiti mentre un avatar individua oggetti potenzialmente pericolosi in tempo reale; se scatta un allarme il personale di sicurezza può concentrarsi sull'area specifica indicata invece di dover ripetere completamente la scansione del passeggero.

Da quando ha assunto la responsabilità dei controlli di sicurezza aerea all'aeroporto di Francoforte, la società di gestione Fraport ha investito circa 22 milioni di Euro per dotare i punti di controllo di sicurezza di tecnologie TC avanzate e di corsie di progettazione innovative.

Dal primo gennaio 2023 Fraport è responsabile dell'organizzazione, della gestione e dell'operatività delle circa 160 corsie di sicurezza dell'aeroporto di Francoforte. La polizia federale nazionale continua ad esserlo anche della definizione dei requisiti generali rilevanti per la sicurezza aerea; della fornitura della supervisione legale e tecnica richiesta; della garanzia della sicurezza aerea complessiva; della fornitura di protezione armata per i posti di blocco; dell'approvazione di nuove attrezzature di ispezione e della certificazione e ri-certificazione degli addetti allo screening della sicurezza aeroportuale.